More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5466 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  75.71 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  84.32 
 
 		 220 aa  310  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  73.83 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  73.36 
 
 		 214 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  76.41 
 
 		 196 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  89.94 
 
 		 214 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  80.87 
 
 		 196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  55 
 
 		 184 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  38.67 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  36.36 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  38.42 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  38.1 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  37.7 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  37.7 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  37.7 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  37.7 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  36.61 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  37.02 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.2 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.68 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  36.96 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  36.31 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.31 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.31 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  37.87 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  40 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  40 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 		 189 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  32.28 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  32.58 
 
 		 179 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  30.81 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.51 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  32.89 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  31.55 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  27.71 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  29.17 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  27.71 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  28.57 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  27.06 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  31.97 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  30.07 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  29.24 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  33.89 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  28.28 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  26.14 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  26.14 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  28.57 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  26.97 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  33.88 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  30.13 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.29 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  34.35 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  30.94 
 
 		 681 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  30.48 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.73 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  30.64 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.67 
 
 		 668 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.02 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.85 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  25.24 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.17 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  26.8 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.9 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.25 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  35.66 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  30 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  30 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  30 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.42 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  28.37 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  25.73 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.25 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>