More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1400 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  100 
 
 		 189 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  69.52 
 
 		 189 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  61.5 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  56.68 
 
 		 187 aa  230  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  51.61 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  51.35 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  50.81 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  50.81 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  48.13 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  45.99 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  35.68 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  35.91 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  36.26 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.26 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  34.07 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  38.92 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  32.29 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  31.98 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  30.82 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  35.92 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.21 
 
 		 220 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  28.81 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  32.87 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  32.39 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  33.79 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  35.71 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  26.09 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  27.08 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  30.14 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  31.25 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  25 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  24.42 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  23.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  23.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  23.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  23.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  23.63 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  26.03 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  25.62 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  23.42 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  30.71 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.94 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  26.15 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  26.53 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  26.15 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  26.15 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  28.86 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  23.62 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  25.9 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.54 
 
 		 664 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  26.59 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.29 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  23.23 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  28.07 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  24.68 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  25 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.04 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  25.44 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.49 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  29.41 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  28.14 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.26 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  22.62 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  25.75 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  25.43 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 		 668 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  32.09 
 
 		 681 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  23.12 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  23.12 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  26.12 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  23.12 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  30.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.74 
 
 		 671 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  30.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  30.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  30.29 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.41 
 
 		 664 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  29.71 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.41 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  27.64 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  29.52 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>