More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1045 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  72.08 
 
 		 198 aa  300  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  71.29 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  70.56 
 
 		 198 aa  297  6e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  71.07 
 
 		 198 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  69.04 
 
 		 197 aa  292  3e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  59.61 
 
 		 201 aa  254  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  59.22 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  51.81 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  37.04 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  32.29 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  30.81 
 
 		 187 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  37.33 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  35.2 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  37.66 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  35.84 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  37.91 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  30.86 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  35.81 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  30.68 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  30.68 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  29.76 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  28.99 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  32.64 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  29.61 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  31.11 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  29.61 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  29.61 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  31.67 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  31.76 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  28.99 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  31.08 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  31.55 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  31.08 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  30.94 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  28.48 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  28.33 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  28.33 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  28.33 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  31.21 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  28.33 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  35.25 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  35.25 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  28.12 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  26.97 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  30.86 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  24.84 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.71 
 
 		 521 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  28.15 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  25.87 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  26.7 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.27 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  26.24 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  26.74 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  27.88 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  26.47 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  28.57 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.63 
 
 		 668 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  25.31 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  23.04 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  25.13 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.85 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  26.32 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  28.96 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  22.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  22.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.85 
 
 		 664 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  22.27 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  22.27 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.32 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  22.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  22.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  22.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>