More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5832 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
189 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  86.24 
 
 
189 aa  307  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  47.9 
 
 
203 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  44.91 
 
 
194 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  36.56 
 
 
193 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  31.38 
 
 
196 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  33.96 
 
 
196 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  37.65 
 
 
189 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  34.95 
 
 
188 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  34.95 
 
 
189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  34.95 
 
 
189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  34.95 
 
 
189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  34.95 
 
 
189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  35.44 
 
 
220 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.44 
 
 
220 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  35.48 
 
 
214 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  33.72 
 
 
204 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  35.48 
 
 
214 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 
187 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  34.84 
 
 
214 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  34.59 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  33.95 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  33.96 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  33.94 
 
 
193 aa  97.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  33.16 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  33.8 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  32.5 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  32.34 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  31.35 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  33.8 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  31.29 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.13 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  33.1 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  30.67 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  30.52 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  31.48 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.29 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  32.57 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  34.46 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.1 
 
 
237 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  28.77 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  39.71 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  28.76 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  32.42 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  28.66 
 
 
325 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  28.66 
 
 
325 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  32.37 
 
 
321 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  27.04 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  30.11 
 
 
245 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  29.94 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  30.88 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  28.14 
 
 
222 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 
259 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  28.08 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  26.99 
 
 
326 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  25.56 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.86 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  32.57 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
363 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 
457 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  28.8 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  26.57 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
458 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
279 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 
216 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  28.23 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  28.23 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  27.84 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  29.66 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  26.52 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  28.16 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  29.94 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  27.44 
 
 
351 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  27.22 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  27.22 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0441  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.88 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  24.28 
 
 
223 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>