282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1607 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  82.12 
 
 
179 aa  308  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  62.44 
 
 
197 aa  259  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  60.78 
 
 
203 aa  257  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  59.61 
 
 
204 aa  254  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  58.88 
 
 
198 aa  250  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  58.88 
 
 
198 aa  248  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  57.87 
 
 
198 aa  248  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  56.48 
 
 
229 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  37.89 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  40.4 
 
 
189 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  35.91 
 
 
189 aa  124  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  32.61 
 
 
187 aa  122  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  35.64 
 
 
190 aa  121  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  37.27 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  34.66 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  34.84 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  31.67 
 
 
212 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  31.67 
 
 
206 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  39.47 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  33.53 
 
 
185 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  33.72 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  30.27 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  33.55 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  31.38 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  33.12 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  31.5 
 
 
220 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  32.48 
 
 
196 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  30.23 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  30.23 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  33.12 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  29.24 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  33.12 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  29.68 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  33.12 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  29.22 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.22 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  30.57 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  34.38 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  34.38 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  30.32 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  35.94 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  30.32 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  30.32 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  30.32 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  30.32 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  27.13 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  31.48 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  29.79 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.8 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  33.33 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  26.83 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  24.04 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.66 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  26.35 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  26.35 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  26.35 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  22.61 
 
 
668 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  30.37 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  22.42 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.52 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  25.89 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.36 
 
 
664 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  25.19 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  22.29 
 
 
223 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.28 
 
 
215 aa  57.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  23.21 
 
 
681 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 
210 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  25.83 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  23.28 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.67 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  23.08 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  23.08 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  22.58 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  32.67 
 
 
332 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  27.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  25.61 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  24.64 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.85 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  23.59 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.41 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  23.35 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.41 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>