More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2869 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  46.95 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  34.25 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  38.01 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  34.94 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  34.17 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  35.57 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  40.4 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  40.4 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  40.4 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  40.4 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  40.4 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  35.37 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  32.68 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.67 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  29.65 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  34.62 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  34.62 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  32.98 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  32.69 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  30.73 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  31.64 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  32.98 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  31.43 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  30.86 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  30.51 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  31.41 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  30.22 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  35.61 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  29.89 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  32.21 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  31.34 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  30.71 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  29.8 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  30.6 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  26.32 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  29.05 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  31.46 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  31.36 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  31.36 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.32 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  20.93 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  28.65 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  36.81 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  33.64 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  27.01 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  24.12 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  34.92 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.99 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  29.87 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.08 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.93 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.31 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  29.23 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  28.14 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.22 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.78 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  34.69 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  28.69 
 
 		 677 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  35.71 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  33.86 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  29.57 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  34.34 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  27.46 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.68 
 
 		 668 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  28.66 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  27.46 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 		 662 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  34.58 
 
 		 672 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  33.67 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  36.04 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>