More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1307 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  69.52 
 
 
189 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  60.43 
 
 
189 aa  235  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  52.41 
 
 
187 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  51.34 
 
 
190 aa  204  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  46.52 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  48.11 
 
 
185 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  48.65 
 
 
185 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  47.57 
 
 
185 aa  178  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  56.76 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  32.61 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  34.66 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  33.52 
 
 
198 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  33.52 
 
 
198 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  40.99 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  31.41 
 
 
203 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  32.95 
 
 
198 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  30.86 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  36.24 
 
 
179 aa  104  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  28.04 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  32.79 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  32.31 
 
 
202 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  32.61 
 
 
212 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  28.27 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  32.43 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  31.76 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  27.69 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  29.69 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  28.38 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.05 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  29.22 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  27.04 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.15 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.15 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.15 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  31.75 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  31.75 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  24.06 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.42 
 
 
218 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.41 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  24.32 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.02 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  24.55 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  24.05 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  23.35 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  23.95 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  22.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  28.89 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  23.35 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  22.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  22.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  22.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  22.03 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  22.75 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  24.69 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  26.95 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  24.55 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  27.27 
 
 
241 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.81 
 
 
676 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  31.9 
 
 
682 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  31.9 
 
 
682 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  24.24 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  25.27 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  25.7 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  23.04 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  25.19 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  24.42 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  23.03 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  24.47 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  23.3 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  23.3 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  22.17 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  22.82 
 
 
218 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  24.56 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  24.52 
 
 
695 aa  54.3  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  22.22 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>