More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0514 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  85.78 
 
 		 204 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  85.78 
 
 		 204 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  85.29 
 
 		 204 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  85.29 
 
 		 204 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  80.2 
 
 		 203 aa  331  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  80.2 
 
 		 203 aa  331  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  80.2 
 
 		 203 aa  331  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  81.68 
 
 		 192 aa  327  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  40.86 
 
 		 191 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  38.66 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  35.26 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  32.34 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  32.34 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  31.01 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.58 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  30.07 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  35.46 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  29.24 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.56 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.14 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.51 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.67 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.6 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28.06 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.13 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  31.87 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.17 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.36 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  25.84 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  30.92 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.92 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  26.99 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  26.82 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  31.35 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  25.4 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.31 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  23.83 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  26.57 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.23 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  27.85 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.94 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  30.27 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.29 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  29.3 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  23.21 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  28 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.45 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.29 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.38 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  25.32 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  24.19 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2788  hypothetical protein  28.22 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.59 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.45 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  27.89 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  23.66 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.83 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  28.83 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  23.66 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  23.66 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  27.89 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  23.66 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.01 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  23.66 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  27.89 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.83 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.83 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  27.21 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.22 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  23.66 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.22 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.83 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>