More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1709 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  73.43 
 
 		 211 aa  306  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  57.6 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  43.56 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  44.53 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  42.18 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  39.29 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.31 
 
 		 457 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  38.85 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  40.58 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  40.43 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.11 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  36.06 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  44.12 
 
 		 245 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.02 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.85 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  42.41 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  38.2 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  37.96 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  37.81 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.08 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  33.72 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  33.72 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  36.9 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  28.51 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  41.55 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  38.18 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  38.81 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  35.33 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  38.1 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.99 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  35.33 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  32.21 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  32.7 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  34.83 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  32.21 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  32.21 
 
 		 678 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  32.69 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.73 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.11 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.34 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.31 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.84 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  41.36 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  33.13 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  31.58 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  31.66 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.83 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.21 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  26.56 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  35.85 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  32.77 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.24 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  31.41 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  33.11 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  30.59 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.24 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.25 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.66 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  34.07 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.58 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  32.91 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  30.39 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  32.87 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  33.56 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  34.75 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.54 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  32.91 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30.18 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.33 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>