More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1186 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  100 
 
 		 355 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  80.66 
 
 		 214 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  79.25 
 
 		 214 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  79.25 
 
 		 214 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  76.89 
 
 		 213 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  51.66 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  56.48 
 
 		 205 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  52.4 
 
 		 217 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  50.99 
 
 		 213 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  47.67 
 
 		 224 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  48.33 
 
 		 199 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.79 
 
 		 215 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  45.1 
 
 		 245 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  38.05 
 
 		 227 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  43.48 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.67 
 
 		 209 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  41.25 
 
 		 209 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  38.99 
 
 		 209 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38 
 
 		 199 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.22 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 212 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 212 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  38.67 
 
 		 206 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.21 
 
 		 211 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  39.11 
 
 		 200 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  39.51 
 
 		 172 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  33.68 
 
 		 218 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.13 
 
 		 521 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  38.31 
 
 		 197 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  38.06 
 
 		 172 aa  96.3  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 		 256 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.55 
 
 		 217 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.92 
 
 		 214 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.79 
 
 		 220 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.16 
 
 		 201 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33.33 
 
 		 218 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.21 
 
 		 220 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.54 
 
 		 220 aa  85.9  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.89 
 
 		 205 aa  85.9  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  36.56 
 
 		 206 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.02 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.12 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  36.08 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.38 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.33 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.75 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  35.75 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  34.23 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.69 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  30 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  26.26 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  29.56 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.68 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  32.54 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  29.79 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  30.3 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  30.05 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.33 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.35 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.82 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.34 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.49 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  24.75 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.72 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  30.25 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.87 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.22 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.41 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  25.93 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>