More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2233 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  90.23 
 
 
266 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  67.34 
 
 
213 aa  271  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  65.33 
 
 
228 aa  264  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  59.35 
 
 
216 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  62.69 
 
 
205 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  56.4 
 
 
215 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  65.32 
 
 
325 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  61.45 
 
 
241 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  53.39 
 
 
225 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  52.66 
 
 
248 aa  208  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.09 
 
 
224 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  47.39 
 
 
224 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  43.65 
 
 
201 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  45.73 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  48.19 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  48.95 
 
 
198 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  45.02 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.55 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  46.51 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  41.55 
 
 
216 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  44.5 
 
 
202 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  40 
 
 
209 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  41.84 
 
 
206 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  45.45 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  39.59 
 
 
214 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
215 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  43.5 
 
 
205 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  47.67 
 
 
228 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  42.64 
 
 
208 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  39.39 
 
 
198 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  42.64 
 
 
205 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 
202 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  47.74 
 
 
217 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  45.12 
 
 
211 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  38.42 
 
 
202 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  42.58 
 
 
241 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.63 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.59 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  42.42 
 
 
203 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  43.53 
 
 
206 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.42 
 
 
207 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.41 
 
 
206 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.47 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  35.61 
 
 
219 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  41.76 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 
208 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.41 
 
 
218 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  35.6 
 
 
213 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  36.36 
 
 
202 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  38.1 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.3 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 
203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  35.86 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 
203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  34.55 
 
 
210 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  36.41 
 
 
199 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 
212 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  36.76 
 
 
200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  36.73 
 
 
198 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  38.54 
 
 
203 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.22 
 
 
219 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  36.92 
 
 
202 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  35.98 
 
 
199 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.51 
 
 
218 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  35.16 
 
 
200 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  31.09 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  38.02 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.65 
 
 
219 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.95 
 
 
222 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  35.26 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  37.62 
 
 
206 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 
218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.69 
 
 
203 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 
197 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  32.84 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  42.59 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  34.07 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  31 
 
 
218 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.84 
 
 
202 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  31.75 
 
 
218 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.67 
 
 
219 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  35.16 
 
 
201 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
178 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  31.68 
 
 
204 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  31.82 
 
 
197 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  34.25 
 
 
200 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  34.81 
 
 
200 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  31.82 
 
 
197 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  30.69 
 
 
201 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>