More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4503 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  96.71 
 
 		 214 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  82.55 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  78.85 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  50.73 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  52.78 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  55.21 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  54.46 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  49.25 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  50.56 
 
 		 199 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.19 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  50.6 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  47.6 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.48 
 
 		 209 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  37.26 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.71 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  39.89 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.54 
 
 		 457 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.14 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  34.38 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 		 172 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.65 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  35.95 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  35.95 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.61 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  36.67 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.44 
 
 		 521 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.63 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  25.93 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  26.54 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  28.73 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.69 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  37.1 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.08 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.18 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  31.61 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33.5 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.34 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.81 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.51 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  28.24 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.29 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.5 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.77 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.05 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  36.25 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.74 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.74 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  27.32 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  28.75 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  27.32 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  25.39 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  27.32 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  32.39 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  26.23 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  27.46 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  33.54 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  27.46 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  28.05 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.05 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  27.32 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.1 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  24.75 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.49 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  30.67 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  28.05 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.39 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  27.84 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  31.54 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  25.75 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.29 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>