More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1554 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  68.25 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  51.22 
 
 		 206 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  50.76 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  45 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  48.26 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  45.67 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  49.7 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  44.67 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  40.58 
 
 		 203 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.97 
 
 		 198 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.12 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.91 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.49 
 
 		 702 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.01 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  41.14 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 		 363 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  35.47 
 
 		 471 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.95 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.31 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.86 
 
 		 211 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  36.71 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  30.73 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 458 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  36.63 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  37.79 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.68 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.27 
 
 		 521 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 		 215 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  36.08 
 
 		 215 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  31.72 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.11 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.61 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  36.16 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.5 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.8 
 
 		 201 aa  85.1  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  35.5 
 
 		 473 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.62 
 
 		 457 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  30.91 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  37.7 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  39.57 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  34.25 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.33 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.99 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.13 
 
 		 664 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  31.84 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.92 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  34.87 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  35.81 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  34.12 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  29.76 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  35.67 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  36.25 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.94 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  32.11 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  31.58 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  34.21 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  32.39 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  37.04 
 
 		 681 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  30.65 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  39.71 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.37 
 
 		 668 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  27.84 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  27.84 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  27.84 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.84 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.74 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  28.72 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  37.58 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  29.23 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  26.63 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  33.78 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  35.19 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  35.5 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.93 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.07 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  31.31 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>