More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0828 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  100 
 
 		 218 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  53.4 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  46.94 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  43.33 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  38.42 
 
 		 471 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  39.09 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  40.27 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 363 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.73 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.58 
 
 		 458 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.31 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  36.31 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  42.14 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  36.26 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.57 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.46 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  36.26 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.21 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6733  membrane protein, DedA family  33.75 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  27.89 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  28.34 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  29.03 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  31.07 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  26.48 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  34.44 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  32.08 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  28.65 
 
 		 678 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  28.65 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  38.13 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35.83 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  30.98 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.45 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.81 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.03 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.97 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  29.93 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  30.89 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.75 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  38.98 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.29 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.28 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  26.83 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.39 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.79 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.73 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.86 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.43 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  34.39 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  24.67 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  33.55 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.46 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  25.39 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  28.43 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  27.03 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  32.06 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.62 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  32.19 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  27.47 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.58 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.77 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  29.56 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  33.68 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 		 702 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>