More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1818 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 209 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  44.5 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  44.5 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  40.3 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  44.62 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  38.64 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  44.72 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  40.64 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  38.79 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  35.22 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.77 
 
 		 237 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  40.52 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  35.1 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.26 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.27 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.95 
 
 		 664 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.59 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 249 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  33.14 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  34.42 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.21 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  37.8 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.65 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.53 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  38.93 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.3 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  42.14 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  34.57 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  38.26 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  33.8 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.29 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.3 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.49 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  32.06 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  32.06 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.3 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.82 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  31.89 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.21 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  33.59 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  36.88 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.06 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  36.22 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.55 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.08 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27.11 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  31.68 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.11 
 
 		 521 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  33.9 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.5 
 
 		 664 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  35.15 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  35.15 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  37.43 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4019  SNARE associated Golgi protein  40.46 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.958973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  24.28 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  33.01 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  31.06 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  35.48 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  32.31 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.67 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  34.64 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  30.41 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  26.49 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  28.46 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>