More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  55.03 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  39.25 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  44.58 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  37.32 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  38.62 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  32.75 
 
 		 471 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.85 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.75 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.14 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.56 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  39.72 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 473 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  35.66 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.54 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  32.07 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.97 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  32.4 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  38.6 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.42 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  33.11 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  33.11 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  32.29 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  33.11 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.09 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.91 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  37.32 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.11 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6733  membrane protein, DedA family  31.9 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.77 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  32.05 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  29.82 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  30.38 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.95 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.72 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.06 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  34.21 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  32.52 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  31.19 
 
 		 241 aa  74.7  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.73 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.8 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.82 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  33.02 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  33.94 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.35 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29.63 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30.66 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  34.07 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  31.08 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  33.78 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  32.85 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  28.57 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.69 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  34.73 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  29.93 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.12 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  32.26 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  33.53 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  31.36 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  32.24 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.75 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  32.59 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  28.77 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  31.52 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  27.38 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  36.36 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>