More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12655 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  100 
 
 
218 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  60.77 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  63.84 
 
 
217 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 
209 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  48.91 
 
 
215 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  46 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  42.28 
 
 
199 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  43.51 
 
 
245 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 
213 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.97 
 
 
209 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  39.75 
 
 
212 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  39.75 
 
 
212 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  38.8 
 
 
227 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
224 aa  99  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 
200 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  41.13 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  38.17 
 
 
256 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.57 
 
 
198 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.07 
 
 
457 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  34.81 
 
 
199 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  33.68 
 
 
355 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  35.55 
 
 
206 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.62 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  38.51 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  36.42 
 
 
204 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 
217 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  35.24 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  36.6 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  36.63 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  37.8 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  38.3 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  31.93 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.93 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.38 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  33.69 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.14 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.59 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  39.1 
 
 
172 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  38.52 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.19 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  34.21 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.19 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  39.13 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.83 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.21 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.34 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.69 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.41 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  32.1 
 
 
471 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  31.11 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.57 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.67 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  38 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  32.59 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  36.18 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  32.64 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.75 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.87 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.78 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.33 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  32.81 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  34.12 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  27.59 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  34.23 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  35.25 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  33.52 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  35.25 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  35.25 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.03 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  35.07 
 
 
221 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  35.96 
 
 
215 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  39.59 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  31.61 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  26.27 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.1 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  30.19 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  35.42 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  34.72 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  35.07 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  31.93 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  34.32 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.65 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>