More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3914 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  82.16 
 
 		 214 aa  343  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  82.16 
 
 		 214 aa  343  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  82.16 
 
 		 214 aa  342  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  76.44 
 
 		 355 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  50.94 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  55.5 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  54.77 
 
 		 213 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  53.85 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  51.3 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.19 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  51.11 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  48.8 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  41.51 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  41.51 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  37.69 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.48 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.83 
 
 		 457 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  41.07 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.4 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  39.51 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  36.13 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.48 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  40.27 
 
 		 172 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  37.25 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  37.25 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.64 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  32.79 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  33.87 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.08 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  30.46 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  34.22 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  31.55 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  30.61 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  31.55 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.36 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  32.53 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.4 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.15 
 
 		 521 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  29.01 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.7 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.85 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  30.53 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.54 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  32.16 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  30.69 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.33 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.05 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  32.56 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  29.66 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.15 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.65 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.63 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.63 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.04 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.65 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  28.33 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  29.31 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  26.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  32.47 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.63 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  25.65 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  29.68 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  28.66 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.66 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.12 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.32 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  25.63 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.81 
 
 		 671 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  31.68 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.52 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.52 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.87 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>