More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1944 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  47.59 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  51.08 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.62 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  50.54 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  47.8 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  44.33 
 
 		 245 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  44.62 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  47.59 
 
 		 355 aa  154  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  44.63 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  48.39 
 
 		 218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  44.81 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.59 
 
 		 457 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.9 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  36.87 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  42.28 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.18 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.46 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  42.47 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.05 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  41.78 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.61 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.82 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 		 172 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  36.09 
 
 		 246 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.25 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.33 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.25 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.25 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.94 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  34.21 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  32.58 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  37.04 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.33 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.49 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.06 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.33 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  39.01 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.58 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.57 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  35.82 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  39.01 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  31.76 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  30.05 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  34.09 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  35.82 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.06 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.08 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  31.06 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.08 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  31.39 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  33.8 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.1 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  32.33 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  30.83 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.87 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  29.41 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  31.3 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  39.81 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>