More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2490 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  49.02 
 
 
215 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  47.89 
 
 
214 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  47.6 
 
 
214 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  47.6 
 
 
214 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  49.49 
 
 
213 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  49.51 
 
 
355 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  46.7 
 
 
213 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  48.47 
 
 
205 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  45 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.3 
 
 
215 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  47.4 
 
 
224 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  43.64 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  42.44 
 
 
217 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  35.33 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.36 
 
 
209 aa  101  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  37.91 
 
 
209 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  37.89 
 
 
206 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.88 
 
 
521 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.26 
 
 
457 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.25 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  34.16 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.68 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  37.09 
 
 
172 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  35.35 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  32.89 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  33.99 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  33.99 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.4 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.63 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.06 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.4 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.4 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.4 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.4 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  26 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  38.02 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.4 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.4 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  26.13 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.71 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.13 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  29.75 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.05 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  30.14 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.21 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  28.36 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  24.19 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  24.87 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  30.08 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.92 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.1 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  30.49 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.49 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.1 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.82 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.93 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  25.48 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.27 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  33.93 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.22 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  25.85 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  27.55 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  30.91 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  32.86 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.45 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  30.38 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  27.98 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  33.11 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.88 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  26.18 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  30.2 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>