More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0625 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  96.53 
 
 		 208 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  77.72 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  78.89 
 
 		 210 aa  328  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  77.66 
 
 		 198 aa  319  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  77.9 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  70.44 
 
 		 206 aa  278  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.28 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  51.03 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  49.25 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  51.83 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  49.75 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.54 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  50.57 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  50.57 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  43.52 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  38.54 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  41.03 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  38.66 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  41.49 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  41.9 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  41.67 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  43.23 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  38.94 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  44.1 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  37.13 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.16 
 
 		 207 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  39.49 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  39.9 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  40.32 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  44.19 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  34.69 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  41.99 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36.68 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.79 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  38.58 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  40 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  39.06 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40.83 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  35.96 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  36.57 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.24 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  37.21 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  35.57 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.63 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.46 
 
 		 228 aa  127  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  41.28 
 
 		 199 aa  127  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.87 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 325 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  35.15 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  35.15 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  35.15 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  35.15 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  38.5 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  34.34 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  40.61 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.05 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.85 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  37.29 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.8 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  37.8 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.27 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  38.82 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  36.41 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  33.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  32.67 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  33.68 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  42.67 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.48 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  35.11 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.69 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.69 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  35.11 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  35.11 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.9 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  35.59 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>