More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0707 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  77.27 
 
 
198 aa  316  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  73.74 
 
 
202 aa  307  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  78.89 
 
 
203 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  78.69 
 
 
207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  79.9 
 
 
208 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  68.97 
 
 
206 aa  263  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  50.75 
 
 
202 aa  207  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.24 
 
 
201 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  50.51 
 
 
201 aa  206  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  48.51 
 
 
203 aa  194  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  50.5 
 
 
199 aa  191  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  50.51 
 
 
202 aa  191  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  50.26 
 
 
200 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  53.22 
 
 
212 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  48.42 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  44.67 
 
 
195 aa  175  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  39.15 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  39.68 
 
 
202 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  43.13 
 
 
215 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  38.19 
 
 
212 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  40.3 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 
218 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  36.89 
 
 
212 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  42.48 
 
 
208 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 
218 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.19 
 
 
203 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  36.32 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  41.61 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  40.91 
 
 
205 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  40.76 
 
 
218 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 
206 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  39.2 
 
 
215 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  40.66 
 
 
213 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 
202 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 
216 aa  134  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  38.86 
 
 
200 aa  134  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  36.82 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.79 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  39.41 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  36.63 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  37.65 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  38.42 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  40.24 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  40.7 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  125  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 
201 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  35.43 
 
 
206 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.06 
 
 
231 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36 
 
 
205 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32.82 
 
 
211 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  35.45 
 
 
198 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.51 
 
 
228 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  37.7 
 
 
202 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.95 
 
 
241 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 
208 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  35.47 
 
 
201 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  35.47 
 
 
201 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  34.63 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  39.55 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  32.32 
 
 
209 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 
239 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  36.56 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  35.47 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.71 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  37.95 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  34.98 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  37.95 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  37.95 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  41.38 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  37.95 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  41.38 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  34.44 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  36.88 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  33.66 
 
 
215 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.74 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  35.96 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.1 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  42.21 
 
 
178 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  37.65 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  37.65 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  36.09 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  40.65 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  37.3 
 
 
200 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  34.34 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  34.98 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  34.98 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  33.84 
 
 
201 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  34.98 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  34.98 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  33.84 
 
 
201 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  33.84 
 
 
201 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  34.48 
 
 
200 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  34.34 
 
 
201 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
197 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  31.47 
 
 
216 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  33.84 
 
 
201 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  35.68 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  33.84 
 
 
201 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>