More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5019 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  96.71 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  96.71 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  82.55 
 
 		 213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  80.29 
 
 		 355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  50.23 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  53.11 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  54.69 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  53.47 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  49.75 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  51.11 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.44 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  50.6 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  49.25 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.48 
 
 		 209 aa  121  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  39.34 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.54 
 
 		 457 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.62 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  40.12 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  33.85 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 		 172 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  35.95 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  35.95 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 		 256 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.76 
 
 		 521 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  36.67 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  28.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  36.56 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  26.54 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.6 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  27.16 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.75 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.69 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.54 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  31.61 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.18 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.88 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.82 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.32 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  32.5 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  30.86 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  28.5 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.5 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.29 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  27.65 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  29.55 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  32.39 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  30.86 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.96 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  31.33 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  31.33 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  31.54 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.48 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.91 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  29.68 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  24.26 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  26.8 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  33.54 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  30.87 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  30.87 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.67 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  30.2 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  27.44 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  26.06 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  27.44 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.38 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.48 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  35 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  24.35 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>