More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0095 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  55.61 
 
 
201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  52.55 
 
 
209 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  57.44 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  54.26 
 
 
198 aa  226  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  53.33 
 
 
208 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  51.74 
 
 
207 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  54.55 
 
 
198 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  49.02 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  52.22 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  52.02 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  48.53 
 
 
202 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  52.25 
 
 
211 aa  193  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.19 
 
 
228 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  50 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  46.81 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  45.41 
 
 
215 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  45.2 
 
 
218 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  47.18 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  49.4 
 
 
219 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  47.62 
 
 
218 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  48.04 
 
 
206 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.62 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  41.4 
 
 
202 aa  161  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  44.79 
 
 
205 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  41.54 
 
 
199 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 
216 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.26 
 
 
241 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  41.84 
 
 
205 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  39 
 
 
214 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 
203 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 
203 aa  151  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  43.48 
 
 
199 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  44.32 
 
 
218 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  43.68 
 
 
325 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.78 
 
 
219 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  37.76 
 
 
212 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  41.55 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  46.67 
 
 
223 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  40.4 
 
 
216 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  45.32 
 
 
266 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  44.83 
 
 
266 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.88 
 
 
205 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
208 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  35.39 
 
 
204 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  38.58 
 
 
198 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  40.3 
 
 
215 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  40.59 
 
 
203 aa  141  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  41.62 
 
 
219 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.41 
 
 
201 aa  140  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  40.8 
 
 
232 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  36.18 
 
 
202 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  35.42 
 
 
203 aa  138  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  35.53 
 
 
201 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  38.1 
 
 
248 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  45.68 
 
 
219 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  36.36 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  33.83 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  33.33 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  43.15 
 
 
241 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  35 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 
208 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  35.83 
 
 
212 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  36.26 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  37.76 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.84 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  35.12 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  45.12 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  38.42 
 
 
224 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  37.37 
 
 
218 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  44.58 
 
 
217 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  35.23 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.07 
 
 
231 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.29 
 
 
222 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  39.64 
 
 
228 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  32.97 
 
 
207 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  33.98 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33.17 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  34.72 
 
 
202 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.18 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  37.76 
 
 
197 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.31 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 
239 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0334  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  30.69 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  31.96 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  31.96 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  30.69 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  35.61 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.5 
 
 
200 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  31.44 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.5 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  31.44 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.5 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.5 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>