More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1601 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  69.31 
 
 
202 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  62.5 
 
 
208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  67.76 
 
 
200 aa  256  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  60.1 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  53.23 
 
 
205 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  49.46 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  47.94 
 
 
218 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  47.94 
 
 
218 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  47.22 
 
 
208 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  46.91 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  44.5 
 
 
211 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  46.77 
 
 
209 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  42.27 
 
 
197 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.86 
 
 
222 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 
200 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  157  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  157  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  39.7 
 
 
200 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  39.7 
 
 
200 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
200 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  39.7 
 
 
200 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  39.41 
 
 
201 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  42.01 
 
 
197 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  43.86 
 
 
200 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  42.01 
 
 
197 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  37.5 
 
 
201 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  38.92 
 
 
201 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 
197 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  38.92 
 
 
201 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  39.38 
 
 
201 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  38.92 
 
 
201 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  39.9 
 
 
201 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  39.9 
 
 
201 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 
218 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  44 
 
 
221 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 
212 aa  151  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  39.43 
 
 
207 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.37 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  39.68 
 
 
210 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  38 
 
 
195 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.83 
 
 
203 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  40.24 
 
 
202 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  39.43 
 
 
198 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 
203 aa  141  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  42.05 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  41.77 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  41.81 
 
 
208 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  37.17 
 
 
203 aa  138  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 
206 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  36.36 
 
 
202 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  38.01 
 
 
199 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  37.81 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  40.96 
 
 
201 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  40.96 
 
 
201 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  37.36 
 
 
200 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  40.36 
 
 
201 aa  134  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  40.96 
 
 
201 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  40.96 
 
 
201 aa  134  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  36.78 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  40.96 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.79 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  40.96 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  41.21 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  41.21 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40.24 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  32.68 
 
 
216 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  38.04 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  37.16 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  36.97 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  37.42 
 
 
202 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  37.77 
 
 
198 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  37.78 
 
 
205 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.61 
 
 
220 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 
206 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  42.31 
 
 
206 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  37.35 
 
 
199 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  41.1 
 
 
199 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  38.62 
 
 
218 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.23 
 
 
219 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  38.67 
 
 
219 aa  121  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.62 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  42.41 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.62 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.75 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  41.77 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  35.47 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.27 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.24 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.89 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.32 
 
 
201 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  35.4 
 
 
198 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  32.6 
 
 
207 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  35.94 
 
 
219 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>