More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3543 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  97.04 
 
 		 203 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  87.13 
 
 		 204 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  87.62 
 
 		 204 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  87.13 
 
 		 204 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  87.13 
 
 		 204 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  88.54 
 
 		 192 aa  348  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  80.2 
 
 		 204 aa  340  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  46.67 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  41.62 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  36.42 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  36.31 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  35.58 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  36.31 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.16 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  32.79 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.25 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.62 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  36.05 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.06 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  30.17 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.05 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  31.87 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  31.87 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  31.87 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  28.89 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  34.04 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  29.61 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.78 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  30.82 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  25 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  32.91 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  26.4 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.1 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.33 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  32.79 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  27.57 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.94 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.94 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.9 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.94 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1136  membrane protein, DedA family  32.14 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  26.7 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  30.56 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  30.72 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.88 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.66 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  24.63 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  22.64 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.66 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>