More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2256 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  49.51 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  49.51 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  51.78 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  51.24 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  45.05 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  47.09 
 
 		 355 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  47.52 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  50.26 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  40.93 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  43.59 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.81 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  46.2 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  40.52 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  40.52 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  37.91 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  36.6 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.14 
 
 		 209 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  34.76 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.62 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  40.14 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.58 
 
 		 457 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.86 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.16 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  41.24 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.35 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  32.92 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  32.92 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.54 
 
 		 521 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  32.92 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  32.92 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.92 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  36.49 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.3 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.53 
 
 		 201 aa  92  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  28.36 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  35.85 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.68 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  29.2 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.87 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.23 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35.22 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  30.1 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.68 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  34.92 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  36.64 
 
 		 279 aa  88.6  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  31.66 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.72 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.05 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  34.09 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.47 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.99 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  30.98 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  31.43 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.81 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.87 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  35.11 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  30.57 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.15 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.76 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.25 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  31.44 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  34.35 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  31.61 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.06 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.5 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.36 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.24 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  31.48 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.81 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  35.32 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  28.82 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>