More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0191 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  84.34 
 
 
198 aa  353  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  51.74 
 
 
201 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  52.55 
 
 
205 aa  228  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  46.12 
 
 
206 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  48.66 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  47.75 
 
 
211 aa  194  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  47.85 
 
 
208 aa  194  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  49.75 
 
 
207 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  47.06 
 
 
220 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  47.45 
 
 
202 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  51.79 
 
 
218 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  50.57 
 
 
218 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  41.71 
 
 
202 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  42.16 
 
 
215 aa  177  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  43.41 
 
 
216 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  45.1 
 
 
219 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  47.98 
 
 
219 aa  175  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.84 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  42.44 
 
 
213 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  42.16 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  43 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.65 
 
 
241 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  44.97 
 
 
325 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.38 
 
 
202 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  38.39 
 
 
216 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  42.2 
 
 
206 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  53.12 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  39.61 
 
 
205 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  39.71 
 
 
215 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  51.22 
 
 
219 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  50.61 
 
 
218 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  40.3 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  42.94 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  43.5 
 
 
200 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  35.24 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  51.57 
 
 
219 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.38 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.58 
 
 
205 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  43.26 
 
 
228 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  41.57 
 
 
203 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  40.1 
 
 
266 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 
203 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 
203 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  38.34 
 
 
199 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  38.86 
 
 
199 aa  141  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  36.19 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  38.97 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  39.6 
 
 
266 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 
208 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  38.67 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  37.37 
 
 
195 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  37.93 
 
 
202 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  44.33 
 
 
223 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  39.89 
 
 
232 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  37.07 
 
 
202 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  38.94 
 
 
203 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  37.31 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  39.22 
 
 
208 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  35.39 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  41.28 
 
 
207 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  35.96 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.93 
 
 
201 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.66 
 
 
231 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  33 
 
 
202 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  34.17 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 
224 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  33.49 
 
 
201 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.39 
 
 
203 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  33.67 
 
 
201 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  33.67 
 
 
201 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
217 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  42.26 
 
 
217 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.57 
 
 
222 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  35.41 
 
 
206 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  32.66 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  33.17 
 
 
201 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  32.16 
 
 
201 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  32.99 
 
 
218 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  34.15 
 
 
241 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  33.99 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  33.99 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.8 
 
 
224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  118  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  32.16 
 
 
201 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  32.16 
 
 
201 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  35.47 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  36.31 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  36.31 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  36.31 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  36.31 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  39.76 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>