More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5318 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  44.67 
 
 		 172 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.1 
 
 		 199 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  43.36 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  43.36 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.2 
 
 		 457 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  35.87 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  37.76 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  37.95 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  37.76 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.73 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  37.19 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  35.68 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  34.41 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  34.15 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  38.46 
 
 		 355 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  35.85 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.68 
 
 		 521 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  35.57 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  28.71 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  32.98 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  41.78 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  30.91 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  30.91 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  31.02 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  30.89 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  30.89 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  30.89 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  30.89 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  30.89 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  29.65 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.59 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  30.89 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.44 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  32.79 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  32.79 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  35.5 
 
 		 245 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  29.84 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  29.84 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  37.89 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  29.17 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  33.33 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.13 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  32.7 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  29.53 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.22 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.05 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.97 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.4 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  30 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  36.22 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30.13 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.21 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  32.93 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  31.33 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.41 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  30.32 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.18 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.38 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  33.99 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  36.32 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  29 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.95 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  36.45 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.15 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  35.96 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.74 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30.41 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  28.28 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  31.38 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  30.58 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.74 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  33.92 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>