More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0543 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
172 aa  340  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  81.98 
 
 
197 aa  288  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  81.98 
 
 
172 aa  288  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  44.67 
 
 
206 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.58 
 
 
457 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  40.25 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
214 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
214 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
214 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  40.27 
 
 
213 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  39.88 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  39.07 
 
 
245 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  39.51 
 
 
355 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  40.29 
 
 
209 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.64 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  35.58 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  35.58 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  34.76 
 
 
204 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 
204 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  35 
 
 
203 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.41 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  33.75 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 
204 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 
204 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 
199 aa  84.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
212 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.1 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  37.91 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  39.1 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  33.11 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 
227 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  37.09 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  34.93 
 
 
224 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.87 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  29.53 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  34.23 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.65 
 
 
521 aa  75.1  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  34.12 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 
279 aa  74.7  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.86 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  33.99 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  30.56 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.36 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  27.52 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.08 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  37.11 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  29.03 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  28.19 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  28.19 
 
 
202 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.48 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  30.61 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1136  membrane protein, DedA family  34.19 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.06 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  34.46 
 
 
678 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  34.46 
 
 
678 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.58 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.84 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.99 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
212 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  32.54 
 
 
213 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  31.39 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.1 
 
 
671 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  33.57 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  37.69 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.56 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  33.9 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  27.27 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  30.58 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  29.34 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.33 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  29.75 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  29.75 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  29.75 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  30.58 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  32.73 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  28.14 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  29.75 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 
325 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 
325 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.68 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>