More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1078 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  62.63 
 
 
202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  61.42 
 
 
199 aa  239  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  55.05 
 
 
202 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  54.04 
 
 
201 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  53.85 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  56.98 
 
 
212 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  51.3 
 
 
201 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  47 
 
 
203 aa  191  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.24 
 
 
205 aa  177  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  44.67 
 
 
210 aa  175  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  45.36 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  46.45 
 
 
207 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  42.13 
 
 
202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  43.52 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  43.52 
 
 
208 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  41 
 
 
206 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  38 
 
 
202 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  46.39 
 
 
208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  37.37 
 
 
209 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  35.03 
 
 
208 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  34.85 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  33.68 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  36.84 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  35.06 
 
 
200 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  34.85 
 
 
202 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 
218 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 
218 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  38.12 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  35.8 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  34.44 
 
 
211 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.78 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  39.04 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  34.64 
 
 
205 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  32.34 
 
 
211 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.24 
 
 
220 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  34.08 
 
 
206 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.18 
 
 
207 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  36.59 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  33.33 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  40.24 
 
 
216 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  39.55 
 
 
215 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  36.31 
 
 
205 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.36 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.38 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  31.46 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  34.3 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  34.88 
 
 
219 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.96 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.9 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  36.16 
 
 
215 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  30.61 
 
 
209 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.11 
 
 
219 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  31.58 
 
 
228 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  37.43 
 
 
219 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
212 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  34.71 
 
 
197 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  33.16 
 
 
202 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.46 
 
 
219 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 
239 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.18 
 
 
221 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  37.99 
 
 
199 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 
216 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.28 
 
 
194 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  33.86 
 
 
199 aa  101  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.28 
 
 
202 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  28.79 
 
 
224 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  35.09 
 
 
201 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  35.09 
 
 
201 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  35.15 
 
 
201 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
202 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  34.5 
 
 
201 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  35.64 
 
 
201 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  34.5 
 
 
201 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  35.09 
 
 
201 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.63 
 
 
241 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.31 
 
 
228 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  29.03 
 
 
213 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  33.92 
 
 
218 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  33.15 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  33.92 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  33.92 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  33.92 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  33.33 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  33 
 
 
201 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  32.63 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  33 
 
 
201 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  34.09 
 
 
232 aa  97.1  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>