More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0427 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  99.02 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  99.02 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  98.04 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  85.78 
 
 		 204 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  87.62 
 
 		 203 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  87.62 
 
 		 203 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  87.13 
 
 		 203 aa  352  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  86.91 
 
 		 192 aa  342  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  45.7 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  39.69 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  35.4 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  35.4 
 
 		 172 aa  88.2  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 172 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  33.74 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  34.18 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.19 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  28.08 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.33 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.04 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.88 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28.12 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.69 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  28.04 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.44 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  25.12 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  29.05 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  35.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.61 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1136  membrane protein, DedA family  32.74 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  26.34 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.16 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.1 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.62 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.14 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  34.17 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  25.99 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  27.53 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  28.68 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  25 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  27.71 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  30.19 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  26.21 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  22.01 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.59 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  29.19 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  29.93 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.71 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  29.93 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.25 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  27.55 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  30 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  24.19 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.22 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  31.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  31.08 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.36 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.22 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>