More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1362 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  100 
 
 		 334 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  48.29 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  48.25 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  40.82 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  42.02 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  37.9 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  37.58 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  40.86 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  38.75 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  39.87 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  42.26 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  39.06 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  39.87 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  36.21 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  39.81 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  40.35 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  35.81 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  34.19 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  39.54 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  37 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  36.58 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  36.91 
 
 		 341 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  36.91 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  36.58 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  36.91 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  36.03 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  36.22 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  42.76 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  36.54 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  36.21 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  36.21 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  36.21 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  36.21 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  36.21 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  36.21 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  34.15 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  34.94 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  31.92 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  30.79 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.22 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.8 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.41 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.08 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  31.98 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  26.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  26.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  23.9 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.84 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  33.77 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  25.84 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  27.88 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.62 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  27.98 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.35 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  25.67 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  30.07 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.07 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  29.81 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27.53 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.65 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.85 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  24.58 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.24 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  27.89 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.97 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  28.27 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  30.4 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.67 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  27.4 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.13 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  26.27 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>