More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1136 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1136  membrane protein, DedA family  100 
 
 		 176 aa  336  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  34.25 
 
 		 237 aa  84  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  35.22 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  35.22 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.56 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.79 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  34.81 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  34.59 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  33.57 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  32.14 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  32.14 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  34.31 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  33.57 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.95 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.74 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  27.94 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.01 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  33.97 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.31 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.49 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  30.67 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.06 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  32.57 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  33.78 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  30.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  30.95 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  32.65 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  32.14 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  31.97 
 
 		 252 aa  72  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 		 227 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  27.21 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  31.65 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.34 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  36.73 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.03 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.68 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.66 
 
 		 219 aa  70.9  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  32.61 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.66 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  30.71 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.3 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  31.85 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.9 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  27.75 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.05 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  29.14 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.21 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  29.14 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  29.45 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  26.19 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.71 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  30.43 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.97 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>