152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2788 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2788  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0456  hypothetical protein  37.32 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0904739  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  31.47 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  28.22 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  28.22 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  28.22 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  27.61 
 
 
203 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  28.22 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  28.22 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.61 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.12 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  28.96 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  28.96 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.79 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.77 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  27.87 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  31.51 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  25.93 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  27.87 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0534  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000300058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.14 
 
 
438 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.19 
 
 
457 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  25.82 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  32.33 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  29.08 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.59 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.26 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.95 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  27.97 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  24.87 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  28.57 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  28.37 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  24.04 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.87 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  26.7 
 
 
215 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  39.76 
 
 
246 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  28.82 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  26.86 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  23.35 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  31.3 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  23.26 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  23.35 
 
 
185 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.95 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  24.09 
 
 
204 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 
221 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 
325 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 
325 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  27.81 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  27.08 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.73 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.04 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  25.86 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  29.75 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  23.35 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  25.66 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.41 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  26.03 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.97 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.35 
 
 
239 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  29.77 
 
 
245 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  32.53 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  23.76 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  26.12 
 
 
169 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  21.43 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.32 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  32.35 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  29.6 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  22.82 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  31.39 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  30 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  27.5 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.17 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  27.5 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  27.5 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  26.47 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  28.48 
 
 
682 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  29.6 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  28.48 
 
 
682 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  31.69 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.47 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.75 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  35 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>