More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0884 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  39.6 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  39.6 
 
 
207 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
212 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  33.7 
 
 
215 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  32.32 
 
 
228 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.03 
 
 
208 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  36.42 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  32.35 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  36.42 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  34.62 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  34.62 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.86 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  33.97 
 
 
165 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  32.75 
 
 
213 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  29.08 
 
 
200 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  29.59 
 
 
200 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  29.84 
 
 
198 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  28.49 
 
 
216 aa  91.3  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  29.59 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  29.59 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  29.59 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  29.59 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  30.96 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.46 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.46 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  29.08 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  30.96 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  33.11 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.75 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  30.46 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  25.56 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  29.08 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  31.93 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.46 
 
 
201 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.46 
 
 
201 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  26.23 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  30.59 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.49 
 
 
224 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  27.07 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  28.06 
 
 
200 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  32.05 
 
 
165 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
200 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.79 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  28.06 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  22.96 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.94 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  28.22 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  28.06 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  23.23 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  29.03 
 
 
200 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  24.34 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.11 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 
325 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.51 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  30.85 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  25.96 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.22 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.22 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  27.74 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  25.39 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.1 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  24.75 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.09 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  26.04 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  33.12 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.24 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  24.38 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  33.12 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  25 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.03 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.87 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.89 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.96 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  25.63 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  24.75 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  29.7 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  26.47 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.96 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  25.25 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  25.44 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>