More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0139 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  92.06 
 
 		 205 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  50.24 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  43.27 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  40.51 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  41.21 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  37.65 
 
 		 267 aa  98.2  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  41.22 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  39.13 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  35.84 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  38.89 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.98 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  31.18 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  38.27 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  39.75 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.05 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  32.76 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  32.29 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.33 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.98 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.2 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.74 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.22 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.08 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  25.93 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  37.78 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.81 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  35.04 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.16 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  39.52 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  25.81 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  23.83 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  28.74 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  33.56 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  24 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.71 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  24.19 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.86 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.4 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  26.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  32.16 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  24.24 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.15 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  30.14 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  28.65 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  30.14 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  30.3 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  30.14 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  30.14 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  30.14 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  30.14 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  30.14 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  27.04 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.83 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  23.26 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  28.32 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  27.96 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  25.4 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  31.14 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>