More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1143 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  84.77 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  45.12 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  42.51 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  46.15 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  42.38 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  38.02 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.14 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  45.91 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  39.25 
 
 		 241 aa  137  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  44.38 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  38.69 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  37.21 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  35.15 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  35.15 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  35.15 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  35.71 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  40.51 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.58 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  28.1 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.81 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.72 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  30.29 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.37 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.5 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.67 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  28.41 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  25.58 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  26.14 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.47 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.49 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  30.16 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  27.04 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.97 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  29.73 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.75 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  29.14 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.72 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  29.73 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.91 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.88 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  27.69 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  31.88 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  23.43 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.81 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.1 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30.3 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  28.81 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  28.71 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  30.32 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  31.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  29.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.97 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  29.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  34.35 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  29.35 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.56 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  28.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  27.07 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.25 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  25.95 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  25.55 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  28.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.45 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.43 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  22 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  30.12 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.75 
 
 		 458 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  33.11 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  29.19 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  27.43 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  24.52 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.33 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.43 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.68 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  27.92 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>