258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1216 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  84.77 
 
 
210 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  46.84 
 
 
251 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  44.21 
 
 
242 aa  165  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  37.5 
 
 
267 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.5 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  43.48 
 
 
241 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  45.91 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  43.54 
 
 
238 aa  134  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  41.84 
 
 
240 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  43.82 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  35.96 
 
 
209 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  35.29 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  35.6 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  36.59 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  30.09 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  28.02 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  27.4 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  29.38 
 
 
268 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.86 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  28.25 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.27 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  32.75 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  30.43 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  32.68 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  29.28 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  34.44 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  26.34 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.7 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25.86 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  26.23 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  25.25 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  24.67 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  27.98 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.7 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.7 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  24.56 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.32 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  26.67 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  27.17 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.79 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  27.08 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  27.83 
 
 
363 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  25.24 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  29.02 
 
 
253 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.67 
 
 
286 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.9 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  33.59 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  34.15 
 
 
677 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  30.37 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  28.39 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  27.75 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.33 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.82 
 
 
458 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  30.07 
 
 
245 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  25.88 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  30.15 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.91 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  22.29 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  26.55 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.67 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  24.09 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.32 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  25 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  24.09 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  27.67 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  26.86 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  28.57 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  24.42 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>