190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0621 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  100 
 
 		 238 aa  463  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  47.92 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  49.75 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  35.9 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  52.51 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.09 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  36.97 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  35.86 
 
 		 210 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  36.67 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  39.24 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  33.17 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  37.23 
 
 		 200 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  37.23 
 
 		 200 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  37.23 
 
 		 200 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  35.06 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.61 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  27.37 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  26.86 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.25 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  32.04 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  31.98 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  25.82 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.2 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.79 
 
 		 702 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.2 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  29.01 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  29.87 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.34 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  26.05 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  26.95 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  25.85 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.19 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  31.4 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  27.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  27.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1854  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  25.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.86 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  31.14 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  25.61 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  28.42 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  25.88 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  31.58 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  31.58 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  27.63 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  29.68 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.91 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.12 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.12 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  30 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  27.11 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  27.5 
 
 		 681 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  29.03 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  29.59 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.61 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  28.39 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  26.74 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  23.94 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25.17 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  25.69 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  27.1 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  28.47 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  29.81 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.5 
 
 		 668 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>