168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0616 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  79.21 
 
 		 205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03240  uncharacterized membrane-associated protein  42.2 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.479554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  33.13 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  30.25 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  30.12 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  28.8 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.81 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.61 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  28.98 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  27.65 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.28 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  28 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.66 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.95 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  29.84 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.1 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  28.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  27.84 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.23 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.88 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  28.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  27.09 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.13 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.13 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.13 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.26 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  27.43 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.22 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  26.6 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.35 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  27.63 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  29.73 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.52 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  30.81 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.18 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  28.1 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.11 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  28.86 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  26.52 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.06 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.92 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  25.34 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  25.34 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  25.6 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  26.59 
 
 		 277 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  29.31 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  26.42 
 
 		 267 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  28.99 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.25 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  32.16 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.37 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.02 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  28.48 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.5 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.86 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  30.13 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.26 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.82 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.45 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  28.71 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  25.32 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  28.34 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  29.87 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  26.06 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>