160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2277 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  29.19 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  35.03 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.38 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.38 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.38 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  32.73 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  30.68 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  30.22 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  26.37 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.29 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  31.06 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  29.87 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  26.88 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.83 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  30.52 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  28.81 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.03 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  30.52 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  30.52 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  28.81 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  30.52 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  30.52 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  31.72 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  28.11 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  31.68 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  31.55 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  26.49 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  32.47 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  27.27 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  22.82 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.56 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  28.09 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.11 
 
 		 521 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  26.7 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  29.68 
 
 		 677 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  28.81 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  28.81 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  28.09 
 
 		 257 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  25.81 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  25.85 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  25.27 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  30.97 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  25.16 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  25.16 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  25.16 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  27.03 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  25.17 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  26.92 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  23.84 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  22.82 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  25.7 
 
 		 256 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  25.81 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  23.81 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  25.67 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  26.78 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  24.52 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  20.26 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  32.03 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  24.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  22.15 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.65 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.33 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>