More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1552 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  61.5 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  42.06 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  40.09 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  39.91 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.34 
 
 		 286 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  41.46 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  38.71 
 
 		 256 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  38.25 
 
 		 259 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.18 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.8 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  38.54 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  40.59 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  37.8 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  37.85 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  37.88 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.69 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  37.32 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  35.98 
 
 		 268 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  36.5 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.51 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  38.69 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  36.18 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  37.93 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  36.14 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  37.13 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  36.95 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  37.32 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.29 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.28 
 
 		 458 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  36.63 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  37.75 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  36.5 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  37.37 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  37.57 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  37.89 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  38.94 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  38.94 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  38.94 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  36.87 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  43.1 
 
 		 234 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  38.1 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  33.66 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  38.58 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  40.57 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  36.95 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  37.56 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  38.69 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  37.8 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  34.47 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  36.23 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  41.18 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  39.39 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  35.08 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  39.04 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  37.88 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  32.69 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  37.11 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  34.78 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  38.07 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  39.41 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  36.6 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  35.1 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  38.34 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  36.6 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>