More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3102 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  100 
 
 		 238 aa  460  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.76 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  55.69 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  49.34 
 
 		 240 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  46.15 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  38.98 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  43.54 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  39.74 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  43.41 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  31.27 
 
 		 267 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  36.1 
 
 		 242 aa  134  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  53.29 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  42.2 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  42.2 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  38.17 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  37.58 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  37.58 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  37.58 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  38.24 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.03 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.68 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  33.14 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  26.9 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  30.22 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.1 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  31.89 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  30.28 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.13 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  27.19 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  22.32 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.17 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.07 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  27.27 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  30.37 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  28.36 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  29.1 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  30.48 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  32.85 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  32.12 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  33.11 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  27.18 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.82 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.28 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  22.84 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  26.21 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  31.13 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  25.27 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1401  DedA family protein  32.03 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  26.29 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  24.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  33.14 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.53 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  25.33 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  23.38 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 		 330 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 		 330 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  25.29 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  37.65 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.89 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  27.03 
 
 		 199 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.15 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  24.51 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  30.38 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  23.91 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  31.16 
 
 		 331 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.14 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  31.16 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  29.17 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  25.68 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0456  hypothetical protein  31.39 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0904739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  30.38 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  26.72 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.86 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  25.36 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.62 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.44 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>