42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1401 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1401  DedA family protein  100 
 
 		 207 aa  413  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0255  DedA protein  29.45 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  32.03 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  24.29 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  30.25 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  32.84 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  24.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  24.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.09 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  23.27 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  28.24 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.58 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  27.07 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  27.39 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  20.49 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  22.41 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.74 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.95 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  27.75 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  28.03 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  22.67 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  24.62 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  32.03 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.81 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  25.52 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  27.4 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.27 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  24.53 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 363 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  22.03 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  29.1 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>