More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4919 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  43.63 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  44.04 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  45.24 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  41.23 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  47.09 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  40.93 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  49.7 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  49.69 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.77 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.15 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  41.28 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  44.51 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  43.65 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  45.68 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  45.74 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  37.88 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  48.84 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  41.1 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  39.46 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  37.71 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  46.39 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  36.22 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  45.34 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  41.94 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  39.88 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  40.82 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  38.01 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  35.35 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  32.32 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  39.35 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  39.35 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  38.24 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.33 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  37.8 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.63 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  33.5 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.63 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  37.3 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  34.81 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  33.16 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.43 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.29 
 
 		 207 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  32.54 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  31.63 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  37.58 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  32.28 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  31.44 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  38.61 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.24 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  32.64 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  30.26 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  34.36 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 		 178 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34.27 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  34.78 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  34 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  34.16 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.47 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.47 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.47 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  31.64 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  31.98 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.47 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.46 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.47 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.57 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.43 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  29.95 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  34.62 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  29.71 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  31.29 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  31.84 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>