272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0212 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  100 
 
 		 191 aa  345  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  45.74 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  38.27 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  35.26 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  35.26 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  35.26 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  32.02 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  37.7 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  33.55 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  31.1 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.09 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.08 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  33.77 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  39.04 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  31.43 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  37.58 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.79 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  26.88 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.98 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.03 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.71 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  30.43 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  36.57 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.03 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  24.06 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  25.83 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.35 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  29.83 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.42 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.16 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  32.33 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  24.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.88 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  34.97 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  25.19 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  29.38 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  32.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  29.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  29.38 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.88 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  32.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  32.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  29.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  32.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  29.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  29.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  29.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  28.03 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  26.35 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.38 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  24.6 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  30.81 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  25.41 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.96 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.7 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.67 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  23.65 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  23.65 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  23.65 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.59 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.38 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  23.03 
 
 		 277 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  27.47 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  25.85 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25.64 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  31.11 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.88 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  27.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  25.29 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  29.68 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  26.75 
 
 		 267 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  27.82 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  27.82 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  27.82 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>