235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0340 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 211 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.16 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.16 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.16 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  28.16 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  30.36 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  33.89 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  31.52 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  26.7 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.21 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  38.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  25.71 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.28 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  34.96 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  34.15 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  26.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  28.29 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  33.14 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  22.99 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  29.75 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.69 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.21 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.98 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  23.53 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  32.37 
 
 		 682 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.09 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  32.37 
 
 		 682 aa  55.1  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  31.05 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  31.64 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  25.64 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  21.64 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  34.68 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  22.52 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.5 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.29 
 
 		 483 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  25.9 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  22.58 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  22.64 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  31.9 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  30.87 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.8 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  27.08 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  28.76 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  27.08 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  27.08 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  27.08 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  27.08 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  24.59 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  24.68 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  33.96 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  27.23 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  27.86 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  30.81 
 
 		 437 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  27.48 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.82 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  25.42 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  31.4 
 
 		 437 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  30.32 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.89 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  30.47 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  25.32 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  25.22 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  29.49 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  27.45 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30.47 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  26.44 
 
 		 363 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  23.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  24.18 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  29.73 
 
 		 695 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  24.64 
 
 		 678 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  27.94 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  24.64 
 
 		 678 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.65 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  25.14 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  30.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  24.71 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.02 
 
 		 668 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  28.07 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  24.71 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  23.12 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.04 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0605  hypothetical protein  23.32 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0553008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>