More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1745 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  93.94 
 
 		 165 aa  309  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  49.69 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  49.69 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  39.02 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  39.02 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 		 212 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  33.99 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  33.12 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  33.99 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  32.47 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  32.05 
 
 		 203 aa  87.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.03 
 
 		 228 aa  85.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  34.64 
 
 		 229 aa  84.7  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  27.34 
 
 		 215 aa  84  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  28.15 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.39 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.69 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  22.92 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.48 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  30.07 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  27.92 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  27.74 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  31.48 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.1 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.84 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.46 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  33.12 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.17 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  24.68 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.64 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  24.52 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  28.28 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.37 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  32.03 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.4 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  29.01 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  26.38 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  34 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  27.01 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  27.21 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  29.37 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  26.19 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.72 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  28.4 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.55 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  25.34 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  31.94 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  26.95 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  28.99 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.97 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.12 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.19 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.85 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  31.65 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.3 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  29.19 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  26.62 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  26.11 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  26.09 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  29.05 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.73 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.31 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.39 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.05 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  27.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  26.62 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.81 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.21 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  30.19 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  27.21 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  30 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.25 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>