More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1476 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  100 
 
 		 165 aa  323  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  93.94 
 
 		 165 aa  309  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  49.07 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  49.07 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  39.63 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  39.63 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  34.64 
 
 		 208 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  35.29 
 
 		 208 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 203 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  29.5 
 
 		 215 aa  89  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  32.47 
 
 		 207 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  31.82 
 
 		 207 aa  87.8  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.85 
 
 		 241 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  28.89 
 
 		 216 aa  84.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  25.31 
 
 		 204 aa  84  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.94 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.72 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.03 
 
 		 202 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 325 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  32.1 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.85 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.41 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  34.42 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  28.22 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.84 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  29.37 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.74 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  25.97 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  30.91 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  32.69 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  31.52 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  28.28 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  32.53 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  27.86 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  28.22 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  31.97 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  28.47 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  27.4 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  34.67 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  29.71 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.3 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  29.08 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  32.7 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 218 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  27.48 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.11 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.93 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.97 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  31.25 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  31.54 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  27.78 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  26.8 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.37 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  27.21 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  31.13 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  27.46 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.4 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.71 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  22.58 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.64 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  26.71 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  30.43 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.69 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.07 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.95 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  30.67 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.48 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  26.38 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.69 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  25.34 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.27 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  27.38 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.27 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  27.33 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>